標題：Uncovering the role of oxygen on organic carbon cycling:insights from a continuous culture study with a facultative anaerobic bacterioplankton species(Shewanella baltica)


揭示氧氣在有機碳循環中的作用：一項關于兼性厭氧浮游細菌（希瓦氏菌屬波羅的海亞種）的連續培養研究帶來的啟示


來源：Frontiers in Marine Science(2024),Volume 11,Article 1328392.

DOI:https://doi.org/10.3389/fmars.2024.1328392


摘要核心內容

研究探討了氧氣濃度對海洋有機碳循環的影響，重點關注兼性厭氧菌Shewanella baltica（波羅的海常見細菌）在脫氧環境下的代謝響應。關鍵發現包括：

低氧限制碳利用：在低氮（LowN）條件下，低氧（<5μmol L?1）抑制溶解有機碳（DOC）吸收和細胞生長；高氮（HighN）時，硝酸鹽作為替代電子受體可補償氧氣限制。

氮損失途徑：

高氮條件：C:N損失比≈2.0，表明反硝化（denitrification）主導，有機碳通過反硝化礦化。

低氮條件：C:N損失比≈5.5，表明異化硝酸鹽還原為銨（DNRA）等其他厭氧途徑占優。

細菌生長效率（BGE）：與氧氣濃度無關，但受氮供應影響（LowN:34±3.0%>HighN:26±1.6%）。

溶解有機物（DOM）動態：富氧條件促進溶解結合碳水化合物（DCCHO）釋放，氨基酸降解指數（DI）指示DOM成巖改變程度更高。

研究目的

明確氧氣減少是否抑制細菌碳利用。

驗證硝酸鹽作為替代電子受體能否維持碳周轉。

揭示不同氧濃度下碳氮循環的耦合機制，及其對富營養化和脫氧水域（如波羅的海）的生態影響。

研究思路

采用連續培養系統（恒化器），以S.baltica為模式生物：

實驗設計：

氧氣梯度：6個水平（5、6、9、15、32、240μmol L?1），覆蓋低氧（<5μmol L?1）至富氧條件。

氮供應：分兩階段（圖1B）：

HighN（Corg:DIN=1.25，前22天）

LowN（Corg:DIN=6.52，后14天）。

恒化器維持恒定體積（4.6 L）和稀釋率（0.626 d?1），確保穩態（圖1A）。

關鍵變量控制：

電子受體：葡萄糖（碳源）vs.硝酸鹽/氧氣（電子受體）。

使用質量流量控制器（MFC）精確調控氣體混合（空氣/無氧氣體）。


測量數據及其研究意義

細菌豐度圖2揭示氧氣和氮可用性對生長的交互影響（e.g.,LowN下低氧抑制生長）。

溶解無機氮（DIN）組分圖3A-B量化硝酸鹽消耗、亞硝酸鹽積累，指示反硝化/DNRA活性（e.g.,低氧時NO??耗盡）。

碳氮周轉速率圖4A-F計算DOC吸收、POC生產及碳氮損失比，明確代謝途徑（e.g.,HighN低氧C:N≈2=反硝化）。

細菌生長效率（BGE）圖5證明BGE受氮供應調控而非氧氣，反映能量分配策略。

溶解結合碳水化合物（DCCHO）圖6-7揭示氧氣對DOM釋放的影響（e.g.,富氧條件增加DCCHO產量，改變糖類組成）。

降解指數（DI）補充圖4基于氨基酸組成評估DOM降解狀態（e.g.,富氧條件DI更低，指示高度降解DOM）。

氧化亞氮（N?O）補充圖1-2驗證反硝化途徑（e.g.,低氧批次實驗中N?O積累）。


結論

氧氣限制的補償機制：

低氧僅當替代電子受體（硝酸鹽）缺乏時（LowN）才限制碳利用（DOC吸收↓、細胞生長↓）。

高硝酸鹽供應（HighN）可維持碳周轉，反硝化主導（C:N損失比≈2.0）。

氮損失途徑的環境意義：

HighN：反硝化促進氮損失，長期緩解富營養化。

LowN：DNRA主導（C:N損失比≈5.5），維持活性氮循環，加劇富營養化。

DOM動態：富氧條件增強多糖釋放（DCCHO↑），促進DOM降解（DI↓），影響碳匯效率。

微生物適應策略：BGE與氧氣無關，但受氮供應調控，反映細菌能量分配的靈活性。


Unisense電極數據的詳細解讀


研究中使用了Unisense STOX傳感器（參考文獻Revsbech et al.2009），其測量意義在于：

超高靈敏度：

檢測限達0.005%O?（≈2 nmol L?1），可精確量化氧最小帶（OMZ）的微氧環境（圖1B）。

傳統方法無法區分<5μmol L?1的濃度，而STOX證實了實驗中O?-5至O?-15處理的亞缺氧狀態（實際<0.5μmol L?1）。

揭示氧敏感閾值：

納摩爾級氧（如O?-32處理的波動）可抑制完全反硝化（至N?），但允許部分反硝化（至N?O）或DNRA進行（圖4E，補充圖1-2）。

解釋了自然OMZ中氮損失過程的空間異質性（e.g.,反硝化僅在嚴格缺氧區發生）。

方法學貢獻：

為微環境氧動力學（如顆粒內部氧梯度）提供關鍵技術支撐，關聯到細菌聚集體的代謝策略（討論提及阿拉伯糖積累指示生物膜形成）。


生態意義：Unisense數據證實即使極低氧（納摩爾級）也能調控碳氮循環路徑，這對預測脫氧水域的碳匯功能和氮收支至關重要。例如，波羅的海深層水體中，此類微氧閾值決定了反硝化效率及溫室氣體N?O的釋放潛力。